學校堅持以學科建設為龍頭，緊密結合經濟轉型升級需求和戰略性新興產業導向，努力提升學科實力和科研水平。現有 “十三五”省一流學科6個，3個碩士學位立項建設授權學科（機械工程、化學工程與技術、土木工程），2個省級重點實驗室（農產品化學與生物加工技術重點實驗室、浙江省食品物流裝備技術研究重點實驗室（培育）），3個省級首批重點科技創新團隊（農副產品生化制造創新團隊、農產品現代物流與質量安全創新團隊、種養廢棄物循環利用與污染防控技術創新團隊）。
先后承擔了國家基金“兩化融合”重點項目、國家社會科學基金、國家自然科學基金、國家星火計劃、省重大科技專項等一系列科研項目，近5年主持獲得省部級及以上獎項17項，已發表論文4000余篇，其中SCI/EI/ISTP三大索引論文800余篇。5年來，與企業共建研發機構（公共科技創新平臺）80余個。一批教授、博士以科技特派員、浙江省塊狀經濟轉型升級專家服務組等身份，積極服務省“兩創”戰略和科技幫扶促調，學校連續3年被評為省科技特派員工作先進單位，為一批企業取得了顯著的經濟效益，贏得了良好的社會聲譽。學校還積極開展國際學術交流與合作，已成立“浙江省國際科技合作基地”、“ZUST-UDE國際合作研究基地”、“中德ZEHN聯合研究所”和“中德綠色建筑研究所”。
